Navadne aminokisline in sinteza beljakovin
Aminokisline, ki se najpogosteje pojavljajo v proteinskih strukturah živih organizmov, se imenujejo navadne aminokisline ali beljakovine. Čeprav je v naravi znanih več kot 500 vrst aminokislin, jih imenujemo navadnih le dvajset. Ob tem se pojavljajo še redkejši, imenovani občasni, ki običajno izhajajo iz presnove navadnih po vključitvi v beljakovinsko verigo. V kolagenu, na primer, najdemo lizin in prolin, dve navadni aminokisline, v hidroksilirani obliki (hidroksiprolin in hidroksilisin).
Večina drugih neobičajnih aminokislin spada predvsem v tvorbo encimov in hormonov beljakovinske narave oziroma peptida (ne smemo pozabiti, da mora biti beljakovina sestavljena iz več kot 100 aminokislin, medtem ko mora tvoriti oligo in en polipeptid zadostuje od 2 do 9 in od 10 do 100).
Med 20 navadnimi aminokislinami se spominjamo
Alanin, arginin, asparagin, asparaginska kislina, cistein, glicin, glutaminska kislina, glutamin, histidin, izoleucin, leucin, lizin, metionin, fenilalanin, prolin, serin, treonin, triptofan, tirozin, valin
Primeri neobičajnih aminokislin so:
karnitin (vključen v prevoz dolgotrajnih maščobnih kislin v mitohondrijih, kjer se uporabljajo za proizvodnjo energije);
ornitin, citrulin in homocistein (ki sodelujejo pri presnovi aminokislin - ciklus sečnine);
hidroksiprolina in hidroksilizina (del sestave kolagena in nekaterih beljakovin);
sarkozin (ali metilglicin).
Nekatere aminokisline imajo lahko tudi komercialni ali farmakološki pomen.
- Natrijev glutamat se v živilski industriji uporablja kot ojačevalnik arome (glej kocka za zaloge).
- L-dihidroksifenilalanin (L-DOPA) je zdravilo za zdravljenje Parkinsonove bolezni.
- 5-hidroksitriptofan (5-HTP) je bil uporabljen za zdravljenje nevroloških simptomov, povezanih s fenilketonurijo (dedna presnovna bolezen, ki preprečuje uporabo fenilalanina, esencialne aminokisline zaradi posebnih pomanjkljivosti encimov; kopičenje fenilalanina v tkivih je odgovorna za hudo poškodbo kože in nevrologijo).
Rastline in bakterije so sposobne proizvajati določene aminokisline, ki jih najdemo v peptidnih antibiotikih, kot sta nizin in alameticin.
Bistvene aminokisline
Nekatere izmed 20 običajnih aminokislin se imenujejo bistvene, saj jih telo ne more sintetizirati iz drugih spojin, ampak jih je treba jemati s hrano.
Pri ljudeh gre za fenilalanin, levcin, izucin, lizin, metionin, treonin, triptofan, valin in pri otrocih histidin in arginin.
Navadne aminokisline, kemijske lastnosti
Na osnovi kemijskih lastnosti radikala R (skupine atomov, ki tvori ne zelo dolgo verigo) lahko aminokisline razdelimo v različne kategorije.
Aminokisline z apolarnim R (ki ne morejo tvoriti vodikovih vezi):
z alifatsko verigo: alanin, levcin, izolevcin, valin, prolin
z aromatsko verigo: fenilalanin, triptofan
z verigo, ki vsebuje atom žvepla: metionin
Aminokisline s polarnim R:
z OH skupino: serin, treonin, tirozin
s SH skupino: cistein
s skupino CO-NH2: asparagin, glutamin
z H: glicinom (edino nekiralno aminokislino)
Aminokisline z osnovnim R:
lizin, arginin, histidin
Aminokisline z kislino R:
glutaminska kislina, asparaginska kislina