Zdravstveni pregled, ki so ga pristojne enote določile za aviarno influenco, ni povezan le z gospodarskim učinkom, ki izhaja iz smrti živali, temveč sproža tudi posebno skrb za javno zdravje . Strokovnjaki najbolj skrbi, da novi virusni podtipi lahko povzročijo bolezen pri ljudeh, predvsem pa se prenesejo od osebe do osebe. Virusi gripe, ki spadajo v tip A, so dejansko podvrženi pojavom genetske prerazporeditve z visoko frekvenco; to omogoča izjemno sposobnost prilagajanja novim gostom in določa neprekinjen pojav novih virusnih sevov . Te mutacije se lahko pojavijo, na primer, ko človeški virus in ptičji virus "izmenjata" svojo genetsko dediščino ali ko virus prehaja iz ene živalske vrste v drugo (prehod s ptic na prašiča je še posebej nevaren). Zato obstaja možnost, da iz živalskega rezervoarja izvira nov virus, za katerega je človek dovzeten (kot se je to zgodilo v zadnjem stoletju, na primer s španskimi virusi A-H1N1 iz leta 1919 ali azijci iz A-H2N2 iz 1957).
Končni prenos med človekom bi omogočil širjenje bolezni na svetovni ravni, kar bi povzročilo pandemijo aviarne influence . Trenutno virusi z najvišjim pandemičnim potencialom ostajajo H5N1 in H7N9, saj še naprej krožijo med piščanci in lahko pri ljudeh povzročijo hude bolezni. Drugi virusni podtipi bi lahko sprožili pandemijo, vendar je tveganje nižje.
