Rumeno mrzlico je mogoče preprečiti s cepljenjem, ki zagotavlja dolgotrajno imunost (več kot 10 let), ki je učinkovita pri 90-95% prejemnikov.
Cepivo, ki ga trenutno odobrava Svetovna zdravstvena organizacija, je sestavljeno iz živega in oslabljenega virusa 17D rumene mrzlice, gojenega na piščančjem zarodku. Cepivo se daje v obliki enkratnega odmerka v nadlaket, ki se obnavlja vsakih 10 let. Zaščitna protitelesa se pojavijo 7-10 dni po inokulaciji.
Cepljenje je poleg tega, da je obvezno za nekatere destinacije, priporočeno tudi za potnike, ki potujejo v endemična območja Afrike in Amerike. Cepivo proti rumeni mrzlici pa je kontraindicirano pri otrocih, starejših od 4 mesecev, in pri nosečnicah; Posebna previdnost je priporočljiva tudi pri ljudeh, ki so alergični na piščančje ali jajčne beljakovine, pri imunsko ogroženih osebah zaradi bolezni ali terapij, pri otrocih, mlajših od 9 mesecev, in pri starejših osebah.
