Verjetnost prenosa toksoplazmoze na plod se spreminja glede na gestacijsko obdobje, v katerem je mati dobila okužbo: tveganje je na začetku nosečnosti majhno in s časom narašča. Nasprotno, resnost poškodbe, o kateri poroča otrok, je večja, takoj ko pride do prenosa mater-fetusa. V primeru okužbe, okužene v šestem mesecu nosečnosti, lahko spontani splav, prezgodnji porod ali plod rojstva povzročijo horioretinitis, hidrocefalus (ali mikrocefalijo) in intrakranialne kalcifikacije. Ti nevrološki znaki so lahko povezani s kožnimi izbruhi, atrofijo vidnega živca, nistagmusom, zlatenico, miokarditisom in pljučnico.
V primeru verjetne in ugotovljene toksoplazmoze mater iz testa Toxo, da bi ugotovili, ali je Toxoplasma gondii dejansko prešel placentno pregrado in okužil otroka, je indicirana amniocenteza (ne pred 15. tednom nosečnosti). Vzorec amnijske tekočine, vzet med preiskavo in podvržen PCR (verižna reakcija s polimerazo), omogoča potrditev morebitne prisotnosti DNK parazita in s tem diagnosticiranje okužbe ploda. Po drugi strani pa lahko ehografski nadzor kaže jasne znake poškodbe ploda (intrakranialne kalcifikacije, hidrocefalus, hepatomegalijo, intrauterino zaviranje rasti). Po rojstvu se sum na prirojeno toksoplazmozo v bistvu potrdi s serološkimi preiskavami in prisotnostjo znakov bolezni, ki se lahko pojavijo celo leta kasneje, zlasti v odsotnosti terapije.
