Danes " karantena " pomeni obdobje izolacije, s spremenljivim trajanjem, ki se uporablja kot previdnostni ukrep v primeru posebej nalezljivih bolezni.
Nastanek te prakse je nastal s prihodom črne kuge . V skladu z izvirnim dokumentom z dne 1377, so bile ladje, ki so prispele v mesto Ragusa (Dubrovnik), prisiljene ostati 30 dni v pristanišču, preden so se lahko izkrcale, in čakale, da se v posadki pojavijo simptomi bolezni.
Približno v istem času so Benetke izdale tudi vrsto ukrepov za zaustavitev širjenja kuga: izolacija je bila podaljšana na 40 dni, beneške oblasti pa so jo imenovale "quarantena" (v italijanščini: štirideset).
Po tem času se je dejansko menilo, da oseba, ki trpi zaradi kuge, ni več nalezljiva. V resnici se je bolezen razširila z bolhami glodalcev in ta preventivni ukrep proti bolezni je bil neuporaben.
Pred in po kugi so se druge bolezni prepustile karanteni, kot so gobavost, sifilis, rumena mrzlica in kolera.
