Diagnoza toksoplazmoze temelji predvsem na raziskavah in kvantifikaciji specifičnih protiteles (IgM in IgG) z indirektno imunofluorescenco ( IFA ) ali imunoenzimskim testom ( EIA ).
IgG proti toksoplazmi se pojavi v prvih dveh tednih akutne bolezni, vrh med 4. in 8. tednom, preden postane nedoločljiv (samo v nekaterih primerih je mogoče najti do 18. meseca po okužbi) . Po drugi strani pa se specifični IgG tvorijo počasneje, največje v 1-2 mesecih in lahko ostanejo visoki in stabilni mesece ali leta. Pri zdravih osebah je predhodna okužba povzročila negativen test na toxo za IgM in pozitiven IgG.
Prisotnost Toxoplasma gondii se lahko dokaže s histološkimi preiskavami, kulturo in PCR za DNK parazitov na vzorcih tkiv in organskih tekočinah (kri, CSF in plodovnica). Poleg teh testov lahko nekateri usmerjeni instrumentalni preiskavi, kot so računalniška tomografija, slikanje z magnetno resonanco, ultrazvok in oftalmoskopija, pomagajo potrditi sum toksoplazmoze.
