Virus Marburg je dobil ime po istoimenskem nemškem mestu, kjer se je prvič pojavil leta 1967, ko je povzročil tri hkratne izbruhe v Nemčiji (mesta Marburg in Frankfurt) in v nekdanji Jugoslaviji (Beograd). V obeh državah je bil virus Marburg verjetno uveden z uvozom ugandskih zelenih opic ( Cercopithecus aethiops, znan tudi kot sivo-zeleni Cercopiteco).
Prvi primeri so bili zabeleženi med osebjem laboratorija v tesnem stiku s temi primati. Sekundarni primeri so vključevali medicinsko osebje v bolnišnicah, ki so bile izpostavljene okuženim biološkim materialom.
Kasneje so bile zabeležene občasne epizode ali izbruhi v Južni Afriki, Keniji, Demokratični republiki Kongo in Angoli, skupaj približno 600 primerov in 480 smrtnih primerov.
