Iridologija se je rodila na Madžarskem v poznem devetnajstem stoletju, toda že v zelo starih časih je bilo opazovanje očesa uporabljeno v diagnostičnem smislu.
V tradicionalni kitajski medicini je na primer proučevanje različnih območij šarenice in biča ustrezalo sestavnim elementom človeka na podlagi načel akupunkture.
Sodobna iridologija se je rodila z madžarskim homeopatskim zdravnikom Ignaziom Von Peczelyjem, katerega raziskave so izhajale iz nekaterih osebnih opazovanj.
Anekdota poroča, da je Von Peczely pri enajstih letih ujel sovo v dvorišču, ki je v poskusu pobega zlomil šapo. Mlada Madžarka je opazila nastanek madeža v šarenici v točki, ki ustreza nogi v topografski shemi šarenice.
Ta znak je prizadel Von Peczely, ki je po določenem času opazil podoben pojav pri človeški šarenici in po zaslugi svojega študija v medicini leta 1880 objavil besedilo " Uvod v preučevanje diagnoze skozi oči " in leta 1886 prva topografija šarenice.