Čeprav je v tem smislu manj nevarna kot alkohol, lahko tudi kofein poveča neželene učinke nekaterih zdravil ali spremeni njegovo delovanje.
Kofein preprečuje delovanje zdravil za nespečnost, antagonizira njihove pomirjevalne učinke in povečuje težave pri spanju.
Pri osebah, ki prejemajo terapijo s teofilinom, aminofilinom ali drugimi sorodnimi ksantinskimi bronhodilatatorji, lahko kofein povzroči razdražljivost, tahikardijo, tremor in živčnost.
Kofein prav tako poveča tveganje za neželene učinke nekaterih zdravil, ki se uporabljajo v psihiatriji, kot je antipsihotični klozapin; prav tako zmanjšuje plazemske ravni litija.
Kinolonski antibiotiki, kot so enoksacin, ciprofloksakcin, grepafloksacin, levofloksacin in norfloksacin, povzročajo, da se kofein kopiči v telesu (visoki odmerki kofeina v telesu lahko povzročijo težave s slabostjo, bruhanjem, živčnostjo, tesnobo, tahikardijo in konvulzijami).
Kofein medsebojno deluje z inhibitorji MAO, kar poveča učinke stimulusa na simpatično. Zato lahko pride do epizod srčne aritmije ali hude hipertenzije zaradi kombinacije zaviralcev MAO in kofeina.
Pri osebah, zdravljenih z antikoagulanti (kumadin - varfarin), antiagregacijsko delovanje kofeina poveča tveganje za krvavitev.
Kofein zmanjša učinkovitost zdravil za zdravljenje urinske inkontinence.
Ko je kofein povezan z nesteroidnimi protivnetnimi zdravili, lahko poveča gastrolezijski učinek slednjega.
Serumske vrednosti kofeina lahko povečamo s sočasno uporabo peroralnih kontraceptivov.
Spomnimo se, da je kofein vsebovan ne samo v kavi, ampak tudi v številnih živilih, kot so koka-kola, energetski napitki in čaj, in v nekaterih prehranskih dopolnilih (na primer tistih, ki vsebujejo kolo, mate ali guarano).
